Il programma in perl fmkmf costruisce un make file per Fortran 90 (o 95) nel caso il programma utilizzi dei moduli. La shell script fmkmf.sh fa la stessa cosa, ma più lentamente. Perché ci si è presi la briga di fare una cosa simile? Il motivo principale è di rendere realmenteil fortran 90 simile al C o al FORTRAN 77. Infatti in questi linguaggi, è possibile compilare il file sorgente in ordine prima di eseguire il collegamento passo-passo.
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